با وجود گذشت چندین سال از مطرحشدن طرح مدیریت یکپارچه شهری، فاز عملیاتی آن بسیار کمرنگ بوده و برداشتهای متعدد و متضادی از نحوه اجرای آن نیز وجود داشته که نبود اراده سیاسی به خاطر مصالح اقتصادی، سیاسی و اجتماعی مهمترین آنهاست، درحالیکه شکلگیری مدیریت یکپارچه شهری از برنامه سوم توسعه مورد تأکید بوده است.